化粪池的基本原理是利用寄生虫卵的比重大于粪尿混合液而产生的沉作用及粪便密闭厌氧发酵、液化、氨化、生物拮抗原理出去和杀灭寄生虫卵及病菌，控制蚊蝇滋生，从而达到粪便无害化目的。 整化池由相联的三个池子组成，中间由过粪管连通，主要是利用厌氧发酵、中层过粪和寄生虫卵比重大于一般混合液而易于沉淀的原理。